Es originalmente el primer episodio, donde Kyon conoce a la nueva estudiante, Haruhi Suzumiya. Esta cuenta su fascinación con los ovnis, viajeros del tiempo y personas con poderes (comúnmente llamados Espers). Kyon y Suzumiya comienzan a hablar, y un día ella le cuenta a Kyon lo aburridos que le parecían los clubes de la escuela, entonces Kyon, inconscientemente, le da la idea de que forme el suyo propio, al que Haruhi luego llama "Brigada SOS". En este episodio también se ve por primera vez a Yuki Nagato y Asahina Mikuru, las dos primeras miembros del club, junto a Kyon, que está allí porque Suzumiya le ha obligado. Kyon, además, recibe un libro de Yuki que esta le encarga leer.

Haruhi quiere tener en su nuevo club algo de tecnología. Para ello, va a la Sociedad para el Estudio de la Informática, donde pide que le regalen una computadora. Al negarse el presidente del club, Haruhi lo chantajea sacándole fotos un poco delicadas con Mikuru. Para que Haruhi no publique estas imágenes falsas, el presidente acepta y le da una computadora, además de toda la instalación de programas, archivos útiles para su nuevo club y una conexión a internet. Al final del episodio, Yuki le dice a Kyon que lea el libro que ella le prestó, puesto que él todavía no lo ha leído. Cuando llega a su casa, Kyon lo hojea y cae una nota para él, de parte de Yuki, diciéndole que debían encontrarse aquella noche. Una vez en la casa de Yuki, esta le revela a Kyon su verdadera identidad.

Yuki completa su explicación de la Entidad Integrada de Datos y como se relaciona con ella y con Haruhi. Luego, habla acerca de los poderes de Haruhi, y como ella puede destruir y recrear el mundo en sólo un parpadeo. Kyon, tratando de entender lo que le ha dicho Yuki, está al principio escéptico de su historia. Al día siguiente, la brigada SOS obtiene un nuevo miembro, un misterioso estudiante transferido llamado Itsuki Koizumi. En un día libre, la brigada SOS busca en la ciudad eventos misteriosos, luego Mikuru le revela a Kyon la existencia de los viajeros en el tiempo. Kyon más tarde habla con Koizumi y éste le explica lo de la "Agencia".

Haruhi está completamente aburrida y no está en su estado normal. Ryōko Asakura, la presidenta de la clase, se preocupa y le pide a Kyon que la ayude. Kyon luego encuentra una carta misteriosa en su casillero, que le dice que se encuentre en un salón, donde se encuentra con Ryōko. Quién se dispone a matarlo, pero es detenida y derrotada por Yuki. Luego, Kyon conoce a la futura forma de Mikuru, que ha viajado desde el futuro para reverlarle una clave esencial para su futuro: Blanca Nieves.

Haruhi se lleva a Kyon para investigar lo que le pasó a Ryōko, ya que Haruhi cree extraño que se transfiera sin previo aviso. Luego de no encontrar nada, Haruhi le dice a Kyon acerca de sus años anteriores, y como ella cambió de ser una chica ordinaria a lo que ella es ahora. Ese mismo día, Itsuki le dice a Kyon sus teorías de la "Agencia" acerca de Haruhi, y le muestra algunos de sus poderes en un espacio cerrado.

Haruhi se vuelve frustrada y celosa de la relación amistosa entre Mikuru y Kyon. Una noche, el poder de Haruhi se activa sin que ella lo sepa. Haruhi y Kyon quedan atrapados en un espacio cerrado de su escuela. Luego, un "Avatar" (Criatura con la cuál Itsuki y sus compañeros luchaban en el episodio anterior) comienza a destruir la escuela y el área que la rodea. Aparecen más Avatares, y Haruhi y Kyon intentan escapar de la escuela. Kyon usa las pistas de Yuki y Mikuru para devolver la situación a la normalidad y escapar.